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｢動員戡亂時期臨時條款｣是為因應國共內戰時期所制訂不受憲法本文限制的法律。｢臨時條款｣授與總統以緊急處分權，並明令於戡亂時期結束後廢止。此條款經國民大會通過於民國37年(1948)5月10日由公布實施，並規定有效期為兩年半。中央政府遷臺後，民國43年(1954)3月國民大會決議繼續生效，之後於民國49年(1960)、民國55年(1966)和民國61年(1972)又進行4次修訂，增加至11項條款。直到民國80年(1991)經國民大會決議後，於5月1日由總統公告廢止。

　　因國共戰事形勢逆轉，民國37年(1948)秋天，中央古文物單位決議將故宮及中央博物院籌備處文物精品遷臺。12月，第一批重要文物由海軍派｢中鼎號｣負責載運，從南京出發運抵基隆。民國38年(1949)1月初，第二批文物則由商船｢海滬輪｣負責運輸，此次運臺文物是數量最多的一次，運抵臺灣後與第一批文物一併置存臺中。1月底由海軍｢崑崙號｣載運第三批文物。這三批故宮文物總共約3千箱。8月，成立｢國立中央博物圖書院館聯合管理處｣，開始整理文物。

　　隨著國共內戰國軍節節敗退情勢逆傳，當時蔣中正總統計畫以臺灣作為反攻復國的基地，在其引退之前，於民國38年(1949)1月1日明令陳誠為臺灣省省主席，為中央政府遷臺以圖再舉做好準備。陳誠於民國38年(1949)間，實施一連串的改革措施：如三七五減租、繼續辦理公地放領、糧食增產、發行新臺幣等等，對於促進臺灣社會及經濟的發展起了相當大的作用，中華民國政府在臺灣的統治也有了更為穩固的政治基礎。

　　太平輪事件發生於中央政府遷臺前的民國38年(1949)1月27日，當時正值小年夜，但在上海黃浦灘岸卻湧現了人潮，除了逃難人士及軍公教人員外，還有一些返臺遊子及商人。近一千人登上了上海中聯輪船公司旗下的｢太平輪｣，因故延遲到下午四點多才航向基隆。由於為躲避宵禁而未開啟航行燈，遂於11點30分在舟山群島海域撞上了載滿煤和木材的建元輪，不久太平輪沉沒，罹難人數超過了九百人，只有三十多人被澳國軍艦救起。民國40年(1951)在基隆港設立紀念碑，以追思緬懷，撫慰傷痛。

　　民國38年(1949)4月21日，共軍渡過長江，國共戰局急轉直下。5月19日，臺灣省政府主席兼臺灣省警備總司令陳誠發布「臺灣省警備總司令部戒嚴令」，自翌日零時起全省實施戒嚴，包括管制出入境與港口、嚴禁罷課罷工及遊行、不得有擾亂市場與治安之情事等。11月2日，行政院通過將臺灣劃為接戰地域，納入全國戒嚴令之範圍，而接戰地域內之地方行政及司法事務移歸該地最高軍事司令官管理。

　　蔣中正引退之後，為強化中國國民黨黨員的｢革命｣精神，重整｢革命｣隊伍，認為必須建立高級訓練機構，遂於民國38年(1949)10月於臺北陽明山成立｢革命實踐研究院｣，由國民黨總裁蔣中正擔任院長。以｢恢復革命精神，喚醒民族靈魂，提高政治警覺，加強戰鬥意志｣為宗旨；教育實施強調理論與實踐的結合。民國42年(1953)於臺北木柵成立分院，民國48年(1959)本分院合併於木柵，民國64年(1975)遷回陽明山，民國89年(2000)改制為國家發展研究院。

　　民國38年(1949)1月蔣中正總統引退，由副總統李宗仁代理總統職務。4月國共和談破裂，共軍渡過長江，南京淪陷。6月蔣中正抵臺北，為中央政府遷臺預作準備。南京淪陷後，中央政府曾先後遷都廣州、重慶及成都，最後仍不敵共軍的攻勢，12月中華民國政府遷都臺北，大陸成為淪陷區，中央政府等相關機構、下轄政府機關及人員在此時前後亦陸續遷至臺灣。

　　民國38年(1949)1月中共提出和談條件，蔣中正總統認為中共並無和談誠意而拒絕合作，但副總統李宗仁卻主張應與中共進行談判，在主和派的壓力下，蔣中正於1月21日引退，由李宗仁代理總統。之後談判破裂，形勢急轉直下，中央政府遷臺，李宗仁卻前往美國以身體欠安為由不願回臺主持大局，於是蔣中正在立法委員敦請下，於民國39年(1950)3月1日復行視事。復行視事幾年間政府有相關紀念活動，李宗仁在美國亦發表解決臺灣問題的言論。

　　民國39年(1950)初，10餘萬國軍撤退到海南島，面對盤據島內的土共以及外來的中共援軍，國軍益顯孤立。中共兩次偷渡成功後，於3月下旬從雷州半島展開大規模的渡島行動，儘管國軍擁有海空優勢，但已無決戰士氣。為保全戰力保衛臺澎，4月高層下令撤守海南並展開部署撤退工作。5月1日共軍攻下海南，5月2日國軍自海南島撤退，7萬多海南島軍民隨國軍從榆林港乘船抵達高雄及基隆。

　　當共軍佔有舟山群島外圍島嶼並在登步島戰役受挫後，於民國39年(1950)4月準備再次大舉進攻舟山群島。共軍攻占海南島後，震動了舟山群島的國軍，此外國軍也漸失去了當地的制空權與制海權，高層遂決定撤軍以保全戰力。5月12日起，開始執行舟山撤退計畫：除破壞當地的碼頭及機場外，在海空軍的佯攻下，從13日至15日連續3夜，陸軍部隊藉夜色掩護撤離舟山，5月20日全數抵臺。除撤出居民2萬多人，官兵12萬5千人及武器裝備外，但亦遺棄多艘船隻。

　　有鑑於中國國民黨日益腐化，民國38年(1949)7月，國民黨總裁蔣中正在廣州首先提出「中國國民黨之改造案」。遷臺後國民黨的改造更加迫切，於民國39年(1950)7月通過「中國國民黨之改造案」。8月5日，中國國民黨中央改造委員會正式成立。9月，改造委員會宣布｢本黨改造綱要｣，開始為期2年的改造工作，於民國41年(1952)10月全部完成。對於黨務革新、加強紀律、強化組織、幹部訓練、社會調查、基層照顧、基本國策、大陸工作等起了相當的作用。

　　民國45年(1956)6月，行政院頒布｢金門馬祖地區戰地政務實驗辦法｣，7月金門、馬祖地區分別成立了｢戰地政務委員會｣，成為當地最高的行政機關，除了戒嚴外，「管、教、養、衛」全以軍管體系運作，金馬地區進入了軍政一元、軍民一體的戰地政務體制，舉凡食、衣、住、行等日常生活都受到管制，並儲訓戰地政務專業幹部以強化當地政經安全及為反攻大陸預做準備。直到民國81年(1992)11月政府宣告解嚴，金馬地區才結束戰地政務實驗時期。